Peso Molecular de la Proteína:
¿Cuánto pesa tu proteína a partir de su secuencia? La calculadora de peso molecular de proteínas de arriba estima la masa molecular de cualquier proteína a partir de su secuencia de aminoácidos, usando el mismo criterio de masas promedio que herramientas de referencia como ExPASy ProtParam.
¿Qué es la calculadora de peso molecular de proteínas?
Es una herramienta que calcula el peso molecular (PM) de una proteína en Daltons a partir de su secuencia de aminoácidos en código de una letra, sumando la masa promedio de cada residuo y añadiendo el peso de una molécula de agua por la formación de la cadena peptídica.
¿Por qué es importante calcular el peso molecular de una proteína?
- Es esencial para interpretar un gel SDS-PAGE o Western blot, donde se compara la banda observada con el peso molecular teórico esperado.
- Permite calcular concentraciones molares a partir de concentraciones másicas (y viceversa) en ensayos bioquímicos y de biología estructural.
- Ayuda a diseñar experimentos de cromatografía de exclusión molecular, donde el tamaño de la proteína determina su tiempo de elución.
- Sirve para verificar construcciones recombinantes, confirmando que una proteína expresada tiene el tamaño esperado según su secuencia.
¿Cómo se calcula el peso molecular de una proteína?
El cálculo suma la masa promedio de residuo de cada aminoácido de la cadena (la masa del aminoácido libre menos una molécula de agua, ya que cada enlace peptídico libera agua) y añade una molécula de agua al final, correspondiente a los extremos N-terminal y C-terminal libres:
Fórmula:
PM = Σ(masa de residuo de cada aminoácido) + masa de una molécula de agua (18.02 Da)
Las masas de residuo usadas son las masas promedio isotópicas estándar (las mismas que usa ExPASy ProtParam), que reflejan la abundancia natural de isótopos de cada elemento.
Ejemplo resuelto: péptido corto «MKWVTFISLL» (10 residuos)
Una secuencia de 10 aminoácidos: Metionina, Lisina, Triptófano, Valina, Treonina, Fenilalanina, Isoleucina, Serina, Leucina, Leucina.
🧬 Cálculo paso a paso
Es decir: este péptido de 10 residuos tiene un peso molecular aproximado de 1,237.57 Da (≈1.24 kDa), resultado de sumar la masa de cada aminoácido de la cadena más el agua de los extremos libres.
Masa molecular promedio aproximada por aminoácido
| Aminoácido | Código | Masa de residuo (Da) |
|---|---|---|
| Glicina | G | 57.05 |
| Alanina | A | 71.08 |
| Leucina / Isoleucina | L / I | 113.16 |
| Triptófano | W | 186.21 |
La tabla muestra solo algunos ejemplos representativos; la calculadora usa las 20 masas de residuo estándar completas para cualquier secuencia que ingreses.
Consejos para obtener un cálculo preciso
- Usa únicamente los 20 códigos de una letra estándar (A, R, N, D, C, Q, E, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V); otros caracteres se ignoran automáticamente y se te avisará cuál.
- No incluyas modificaciones postraduccionales (glicosilación, fosforilación, etc.) en el cálculo, ya que este solo considera la cadena polipeptídica base.
- Verifica tu secuencia contra la base de datos original (UniProt, GenBank) antes de calcular, para evitar errores de transcripción.
- Recuerda que el peso real en un gel puede diferir ligeramente del teórico por modificaciones postraduccionales, plegamiento o composición inusual de aminoácidos.
Preguntas frecuentes
¿Esta calculadora da el mismo resultado que ExPASy ProtParam?
Sí, usa el mismo conjunto de masas promedio de residuo de aminoácido que ExPASy ProtParam, por lo que el resultado para una secuencia idéntica debería coincidir o ser prácticamente idéntico.
¿Qué pasa si mi secuencia tiene caracteres no reconocidos?
Los caracteres que no correspondan a uno de los 20 aminoácidos estándar (por ejemplo, «X» para aminoácido desconocido o «B»/»Z» ambiguos) se ignoran automáticamente en el cálculo, y la calculadora te muestra una advertencia indicando cuáles fueron descartados.
¿Por qué se suma una molécula de agua al final?
Porque las masas de residuo ya tienen descontada el agua que se libera en cada enlace peptídico durante la formación de la cadena. Al sumar una molécula de agua se restituye el grupo -OH del extremo C-terminal y el -H del extremo N-terminal de la proteína completa.
¿Esta calculadora considera puentes disulfuro o modificaciones?
No. Calcula el peso molecular teórico de la cadena polipeptídica lineal sin modificaciones. Los puentes disulfuro no cambian la masa (solo la estructura), pero otras modificaciones postraduccionales sí alterarían el peso real observado.